马来西亚大学工程学院有多个，其中马来西亚理工大学工程学院包括土木工程学院、机械工程学院、化学及自然资源工程学院等，马来西亚理科大学工程学院坐落在工程校区，拥有多个不同类型的学院，而马来亚大学工程学院提供化学工程、机械工程、材料工程、环境工程等专业。
马来西亚理工大学工程学院
马来西亚理工大学是马来西亚最著名的国立大学之一，其学科包括机电工程、化学工程和自然资源工程、环境建设、土木工程、医学工程、综合科学、管理和人力资源开发、教育、地理信息科学和工程等领域。UTM是工程、科学和技术领域领先的创新驱动型研究型大学。
设有土木工程学院、电气工程学院、机械工程学院、化学及自然资源工程学院、地理信息科学及工程学院，提供电气工程、机电安装工程、电子工程、电信网工程项目、计算机工程、电子光学工程项目、医用电子工程项目、生物医学工程、机械工程、航空公司机械工程、小车机械工程、海洋技术机械工程、机械设备材料工程、工业生产机械工程、生产制造工程项目、工业产品设计、微生物生产加工工程项目、燃气化学工程等专业。
马来西亚理科大学工程学院
马来西亚理科大学，简称“理大”，成立于1969年，拥有主校区（槟岛）、工程校区、医学校区三个校区，占地面积15,000亩。马来西亚理科大学是大马建立的第二所国立大学，也是马来西亚五所研究密集型大学之一。
工程校区在坐落于槟州的高渊，设置在该校区的学院有：土木工程学院、电气与电子工程学院、航空航天工程学院、化工学院、机械工程学院、材料与矿产工程学院。
马来亚大学工程学院
本科专业：马来亚大学工程学院下设有生物医药工程学、化学工程学、电气工程学、土木工程学、机械工程学等等本科专业。另外还设有生物医药工程学（修复及矫正）、环境工程学、材料工程学、制造工程学、机械工程学士（产品设计）以及电气工程学士（通讯）专业，但这些专业在2018/2019第一学期未开放。
硕士专业：马来亚大学工程学院下设有工程学硕士（制造工程）、工程学硕士（电力系统）、工程学硕士（通讯工程）、工程学硕士（材料工程）、工程学硕士（机械工程）、工程学硕士（工业电子学及控制）、工程学硕士(安全健康与环境硕士)、工程学硕士（机械电子学）、工程学硕士（生物医学）、工程科学硕士专业（上述专业均为博士专业）。
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